DSpace

Πληροφορίες Τίτλου
Τίτλος: Πρωτοταγής Οργάνωση Βιολογικών Αλληλουχιών
Συγγραφείς:Νικολάου, Χριστόφορος
Χουβαρδάς, Παναγιώτης
Κριτικός Αναγνώστης: Μπάγκος, Παντελεήμων
Σχολές/Τμήματα: ΤΜΗΜΑ ΒΙΟΛΟΓΙΑΣ, ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΚΡΗΤΗΣ
Θέμα: 
Λέξεις-κλειδιά: 
ΒΙΟΠΛΗΡΟΦΟΡΙΚΗ
ΥΠΟΛΟΓΙΣΤΙΚΗ ΒΙΟΛΟΓΙΑ
ΒΙΟΣΤΑΤΙΣΤΙΚΗ
ΑΛΓΟΡΙΘΜΟΙ
ΜΗΧΑΝΙΚΗ ΜΑΘΗΣΗ
Περιγραφή
Περίληψη: 
Στο προηγούμενο κεφάλαιο εξετάσαμε τις ιδιότητες βιολογικών αλληλουχιών εστιάζοντας στη σύστασή τους και αντιμετωπίζοντάς τις σαν σύνολα συμβόλων. Ωστόσο μια από τις βασικές ιδιότητες όλων των βιολογικών αλληλουχιών είναι η οργάνωσή τους σε ό,τι αφορά τη διαδοχή των δομικών τους στοιχείων, αυτό που ονομάζουμε πρωτοταγή διάταξη. Στο κεφάλαιο αυτό περνάμε σε προβλήματα που σχετίζονται με τη διαδοχή των καταλοίπων σε βιολογικές αλληλουχίες και τρόπους για την ανάλυσή της. Το βασικό βιολογικό ερώτημα γύρω από το οποίο διαρθρώνεται το κεφάλαιο είναι η διάκριση αλληλουχιών με βάση τη λειτουργικότητά τους. Σε βιολογικό επίπεδο, εξετάζονται έννοιες όπως οι συνεμφανίσεις καταλοίπων σε βιολογικές αλληλουχίες (γιατί κάποια νουκλεοτίδια ή αμινοξέα τείνουν να εμφανίζονται σε άμεση διαδοχή και άλλα όχι) καθώς και γενικότερες χαρακτηριστικές ιδιότητες πρωτοταγούς οργάνωσης αλληλουχιών. Η βασική μαθηματική έννοια που συνδέεται με τη διαδοχή καταλοίπων και τη μελέτη των συνεμφανίσεών τους είναι αυτή της δεσμευμένης πιθανότητας η οποία παρουσιάζεται στη συνέχεια. στο πλαίσιο της περιγραφής σύνθετων δεσμευμένων πιθανοτήτων, γίνεται αναφορά στον κανόνα του Bayes και στη σημασία του. Στο δεύτερο μέρος του κεφαλαίου εισάγουμε τα Μοντέλα Markov ως ένα από τα βασικά υπολογιστικά εργαλεία για την αναλύση της πρωτοταγούς δομής αλληλουχιών και παρουσιάζουμε αναλυτικά τους σχετικούς αλγορίθμους για τη μοντελοποίηση βιολογικών αλληλουχιών ως πιθανοκρατικών διαδικασιών Markov.

Στο τέλος του Κεφαλαίου θα πρέπει να μπορείτε:
Να κατανοήσετε έννοιες όπως η ανεξαρτησία ενδεχομένων και η δεσμευμένη πιθανότητα.
Να αξιολογήσετε τη διαγνωστική ικανότητα μιας μεθοδολογίας με βάση την ευαισθησία της, χρησιμοποιώντας τον κανόνα του Bayes.
Να περιγράψετε μια στοχαστική διαδικασία μέσω των Μοντέλων Markov.
Na χρησιμοποιήσετε Μοντέλα Μarkov για να υπολογίσετε τη συνολική πιθανότητα μιας διαδικασίας.
Να αναλύσετε βιολογικές αλληλουχίες με Μοντέλα Markov.
Ημερομηνία Δημιουργίας: 2015
Πληροφορίες Τεκμηρίου
Είδος Τεκμηρίου: Κεφάλαιο Συγγράμματος
URI: http://hdl.handle.net/11419/1580
Βιβλιογραφική Αναφορά:Νικολάου, Χ., Χουβαρδάς, Π. 2015. Πρωτοταγής Οργάνωση Βιολογικών Αλληλουχιών. [Κεφάλαιο Συγγράμματος]. Στο Νικολάου, Χ., Χουβαρδάς, Π. 2015. Υπολογιστική βιολογία. [ηλεκτρ. βιβλ.] Αθήνα:Σύνδεσμος Ελληνικών Ακαδημαϊκών Βιβλιοθηκών. κεφ 3. Διαθέσιμο στο: http://hdl.handle.net/11419/1580
Γλώσσα: Ελληνικά
Αποτελεί μέρος του: Υπολογιστική βιολογία
Άδεια Χρήσης: Αναφορά - Μη Εμπορική Χρήση - Όχι Παράγωγα Έργα
Σχετικά Μαθήματα: 
1. Μ-Υπολογιστική Βιολογία [ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΚΡΗΤΗΣ, ΣΧΟΛΗ ΘΕΤΙΚΩΝ & ΤΕΧΝΟΛΟΓΙΚΩΝ ΕΠΙΣΤΗΜΩΝ, ΤΜΗΜΑ ΒΙΟΛΟΓΙΑΣ]
2. Αλγόριθμοι και Βιοπληροφορική [ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΚΡΗΤΗΣ, ΣΧΟΛΗ ΘΕΤΙΚΩΝ & ΤΕΧΝΟΛΟΓΙΚΩΝ ΕΠΙΣΤΗΜΩΝ, ΤΜΗΜΑ ΕΠΙΣΤΗΜΗΣ ΥΠΟΛΟΓΙΣΤΩΝ]
3. ΒΙΟΠΛΗΡΟΦΟΡΙΚΗ [ΕΘΝΙΚΟ & ΚΑΠΟΔΙΣΤΡΙΑΚΟ ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΑΘΗΝΩΝ, ΣΧΟΛΗ ΘΕΤΙΚΩΝ ΕΠΙΣΤΗΜΩΝ, ΤΜΗΜΑ ΒΙΟΛΟΓΙΑΣ]
4. ΒΙΟΠΛΗΡΟΦΟΡΙΚΗ Ι [ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΣΤΕΡΕΑΣ ΕΛΛΑΔΑΣ, ΣΧΟΛΗ , ΤΜΗΜΑ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΚΗΣ ΜΕ ΕΦΑΡΜΟΓΕΣ ΣΤΗ ΒΙΟΙΑΤΡΙΚΗ (Μεταφέρθηκε σε άλλο Ίδρυμα)]
5. ΒΙΟΠΛΗΡΟΦΟΡΙΚΗ ΙΙ [ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΣΤΕΡΕΑΣ ΕΛΛΑΔΑΣ, ΣΧΟΛΗ , ΤΜΗΜΑ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΚΗΣ ΜΕ ΕΦΑΡΜΟΓΕΣ ΣΤΗ ΒΙΟΙΑΤΡΙΚΗ (Μεταφέρθηκε σε άλλο Ίδρυμα)]
6. ΕΙΣΑΓΩΓΗ ΣΤΗΝ ΥΠΟΛΟΓΙΣΤΙΚΗ ΒΙΟΛΟΓΙΑ [ΔΗΜΟΚΡΙΤΕΙΟ ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΘΡΑΚΗΣ, ΣΧΟΛΗ ΕΠΙΣΤΗΜΩΝ ΥΓΕΙΑΣ, ΤΜΗΜΑ ΜΟΡΙΑΚΗΣ ΒΙΟΛΟΓΙΑΣ ΚΑΙ ΓΕΝΕΤΙΚΗΣ]
Τύπος έκδοσης: Εκδόσεις Κάλλιπος
Εμφανίζεται στις συλλογές:Ιατρικές Επιστήμες και Επιστήμες της Ζωής

Αρχεία σε αυτό το τεκμήριο:

Μορφότυπο Μέγεθος Περιγραφή
Adobe PDF4,62 MB-KατεβάστεΔείτε

Όλα τα τεκμήρια του δικτυακού τόπου προστατεύονται από πνευματικά δικαιώματα

Όροι χρήσης HEAL-Link © 2015

HEAL-Link NTUA GRNET European Union EDULLL ESPA