Θεωρία και εργαστηριακές ασκήσεις στην ανίχνευση πεπτιδίων, Διαδίκτυο και βάσεις δεδομένων πρωτεϊνών

Abstract

Τα πεπτίδια και οι πρωτεΐνες αποτελούν είτε δομικά συστατικά των μεμβρανών του κυττάρου είτε συνεργούν σε κάποια συγκεκριμένη λειτουργία, όπως η δημιουργία πρωτεϊνικών συμπλόκων. Είναι μεγάλα σύνθετα βιομόρια, με ΜΒ από 10.000 μέχρι πάνω από 1.000.000, αποτελούμενα από αμινοξέα, τα οποία ενώνονται μεταξύ τους με πεπτιδικούς δεσμούς σχηματίζοντας μια γραμμική αλυσίδα, καλούμενη αλυσίδα πολυπεπτιδίων. Στο παρόν κεφάλαιο θα επικεντρωθούμε στους δομικούς λίθους (αμινοξέα), στον σχηματισμό, στις ιδιότητες, στις δομές στην απομόνωση/διαχωρισμό, στις βάσεις δεδομένων, καθώς και σε μια σειρά μεθόδων εργαστηριακού προσδιορισμού των αμινοξέων, πεπτιδίων και πρωτεϊνών.

Peptides and proteins are either structural components of cell membranes or cooperate in some specific function, such as the formation of protein complexes. They are large complex biomolecules, with MB from 10,000 to over 1,000,000, composed of amino acids, which are joined together by peptide bonds forming a linear chain, called a polypeptide chain. In this chapter, we will focus on building blocks (amino acids), formation, properties, structures, isolation/separation, databases, and a range of methods for laboratory determination of amino acids, peptides, and proteins.