ΠΡΩΤΕΥΟΝΤΑ ΙΙΙ (Χρήση μοριακών δεδομένων και κατασκευή κλαδογραμμάτων)

Abstract

Το κεφάλαιο αποσκοπεί αφενός στη εξοικείωση των φοιτητών στη χρήση της γονιδιακής τράπεζας δεδομένων (Gene bank) και αφετέρου στην εφαρμογή των πιο γνωστών υπολογιστικών μεθόδων για την κατασκευή φυλογενετικών δέντρων με τη χρήση μοριακών δεδομένων. Η ερμηνεία των γενετικών δεδομένων αποτελεί βασική προϋπόθεση για την κατανόηση εξελικτικών φαινομένων όπως είναι η προσαρμογή και η βιολογική ιστορία των πληθυσμών ή των ειδών. Εδώ και πολλά χρόνια οι ανθρωπολόγοι έχουν χρησιμοποιήσει και χρησιμοποιούν μια ποικιλία μοριακών μεθόδων για την μελέτη της φυσικής ιστορίας του ανθρώπου αλλά και των άλλων πρωτευόντων. Οι φοιτητές μαθαίνουν να αναζητούν νουκλεοτιδικές αλληλουχίες βάσεις δεδομένων, να τις επεξεργάζονται και να τις συγκρίνουν. Στη συνέχεια με τη χρήση λογισμικού, προσπαθούν για την ανασύσταση και αναπαράσταση των φυλογενετικών σχέσεων μέσω μεθόδων αποστάσεων (Neighbor Joining) ή μεθόδων χαρακτήρα (Maximum likelihood). Τα αποτελέσματα αποτυπώνονται σε ένα φυλογενετικό δένδρο.